鴻藻生技的主要產品「藻紅蛋白」為自台灣鄰近海域新發現本土藻種分離、純化的天然螢光蛋白試劑。經特定雷射波長 (488 nm & 561 nm) 激發下會發射強烈螢光，螢光強度是一般常見螢光素 (Ex: FITC, PerCP, Alexa, HiLyte Fluor) 的 30-100 倍，具有良好的吸光性能 (496, 546, 565 nm) 及⾼量⼦產率、高辨識度、低衰退率等特性。⼤部分實驗室所具備之螢光分析檢測儀器，如：流式細胞儀 (Flow Cytometry)、免疫螢光顯微鏡 (Immunofluorescence Microscopy, IF) 皆可搭配使⽤。

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與多家國際藻紅蛋白製造商進行競品測試，鴻藻 R-PE 螢光亮度與全球市占第一名 Agilent 同樣高。